CRISPR/Cas9 質粒服務,助力sgRNA表達和基因編輯
金斯瑞提供的CRISPR材料來源于張鋒實驗室,所提供的CRISPR產品和服務得到美國 Broad 研究所授權許可。包括:
- 已經被MIT設計并驗證的sgRNA序列
- 包含all-in-one和Dual 多種類型的載體選擇,并可根據需要篩選抗性
- 經MIT驗證的空載類型
- 多種Cas9 類型:包含eSpCas9,SpCas9,SpCas9 Nickase,SaCas9和SAM
服務優勢
-
特異性sgRNA序列
sgRNA序列由MIT驗證 -
全基因組數據庫
野生型SpCas9和SAM的人或小鼠的sgRNA序列庫 -
及時交付
20,000+條sgRNA隔天交付* -
專業設計工具
可設計多達12個物種的gRNA序列
CRISPR gRNA數據庫
金斯瑞提供超20,000 種含有gRNA序列的plentiCRISPRV2質粒,所有sgRNA序列已經被MIT驗證。在數據庫中,您可通過搜索基因名稱,基因標志或ID來查找相關gRNA。
服務 | 表達系統 | 篩選標記 | |
---|---|---|---|
GenCRISPR質粒庫 | Lentiviral | Amp, Puro | gRNA 數據庫 |
為滿足您多種需求,金斯瑞不僅提供多種Cas9類型的定制質粒,也提供經由MIT驗證的空載供您選擇。
一、定制質粒類型
根據Cas9類型,定制質粒包含如下幾種:
-
增強CRISPR/SpCas9質粒 - eSpCas9 New
特異性增強SpCas9 (Enhanced specificity SpCas9, eSpCas9),指的是?SpCas9 (K848A/K1003A/R1060A),是經過MIT張鋒實驗室特異性改造的質粒(Slaymaker?et al.?2016).eSpCas9可以降低脫靶效率,比自然SpCas9脫靶效率降低10倍之多,同時可實現基因高效編輯。
Cas9基因組編輯依賴于DNA雙鏈的分離。sgRNA與非靶向DNA序列的不匹配可能導致非特異性結合和分裂。為了提高基因組編輯的特異性,科學家開發了突變為K848A、K1003A和R1060A的eSpCas9。在SpCas9的非靶鏈溝槽內中和這些帶正電荷的殘基,既可以減少非靶結合,也可以刺激靶向結合,這一操作需要更嚴格的Watson-Crick堿基配對。
服務 表達系統 篩選標記 eSpCas9質粒 Plasmid
LentiviralPuro
GFP獲取報價 -
SpCas9質粒 Hot
Cas9內切酶是基因編輯的研究標準。當與單導RNA (single guide RNA,sgRNA)序列結合時,這些酶在基因組中產生位點特異性雙鏈斷裂(double strand breaks, DSBs)。
- SpCas9/sgRNAs可以在all-in-one載體中表達,也可以在dual載體中單獨表達。
- 優選的靶上SpCas9 PAM序列為NGG。
- SpCas9還包含NGA序列的目標親和力。
服務 表達系統 篩選標記 SpCas9 Plasmids Plasmid
Lentiviral AAVAmp
Amp, Puro
Amp, Neo
Amp, GFP獲取報價 -
SpCas9 Nickase質粒
SpCas9 nickase (Cas9n D10A)包含一個突變,不同于SpCas9切割時形成DSB, SpCas9 nickase在切割序列時形成單鏈缺口。經過SpCas9 nickase切割后,兩個相對的gRNA序列可以有效配對,因為這種方法可以避免不必要的插入。
服務 表達系統 篩選標記 SpCas9 Nickase Plasmids Plasmid
LentiviralAmp
Amp, Puro
Amp, GFP獲取報價 -
SaCas9質粒
黃色葡萄球菌Cas9同源體(Staphylococcus aureus?Cas9 orthologue,SaCas9)是腺相關病毒(adeno-associated virus (AAV AAV)應用的理想內切酶。SaCas9比SpCas9大約短1kb,這允許了在AAV組裝時更加靈活。AAV載體較低的免疫原性,使SaCas9非常適合于體內編輯的。
- 優選的靶SaCas9 PAM序列為NNGRRT。
- SaCas9 對NNGRRN也有很高的親和性。
服務 表達系統 篩選標記 SaCas9 plasmids AAV Amp 獲取報價 -
轉錄激活(Transcription Activation, SAM)質粒
CRISPR/Cas9協同激活介質(SAM)系統已被設計用于激活下游目標的轉錄。SAM系統使用三種不同的激活因子,VP64、P65和HSF1,它們被組裝到催化失活的Cas9(dead Cas9,dCas9)復合物上驅動轉錄。
- SAM復合物由三個組分組成:一個由兩個MS2 RNA適配體組成的gRNA、一個催化失活的dCas9-VP64融合蛋白,和一個MS2-p65-hsf1激活因子融合蛋白。
- SAM系統能夠激活編碼和非編碼的元素。
- 查找經由MIT驗證的SAM gRNA序列,請前往gRNA數據庫。
二、空載服務
為滿足您的科研需要,金斯瑞提供空載服務,載體序列已經由MIT驗證。這些載體包含一個17bp-1.8kb的可表達連接體,以代替定制的sgRNA序列,您可根據需要對其進行修改。
SpCas9 載體
Cas9內切酶來源于II型CRISPR系統?;撔枣溓蚓?SpCas9)是第一個為哺乳動物基因組編輯Cas9酶。當與gRNA 序列結合后,這些酶可以在特定位點上進行基因組雙鏈斷裂。因其簡捷性,特異性以及高效性,CRISPR / Cas9系統在基因組編輯中廣泛使用,金斯瑞提供Broad研究所驗證的 WT SpCas9可用于哺乳動物基因組編輯。 WT SpCas9的交付載體有兩種形式, All-in-one?和Dual 類型,可用于非病毒性,慢病毒型lenti-viral?,以及腺相關病毒(AAV)的轉染。其中,慢病毒類型兼容第二代和第三代慢病毒包裝質粒。
SpCas9 Nickase載體
雖然CRISPR / Cas9技術與其他基因編輯技術相比是比較明確的,但是脫靶仍然是一個難題。為了提高特異性,科學家們對Cas9核酸內切酶進行了修改。WT Cas9有兩個催化域, RuvC 和 HNH,在這些域中進行催化殘基突變(特別是RuvC D10A和HNH H840A),形成單鏈缺口與雙鏈斷裂(Ran et al, 2013)。這些Nickase Cas9酶,或Cas9n,由gRNA 引導至靶基因組DNA的另一端。細胞將通過HDR優先修復這些SSBs而不是NHEJ。通過HDR機制可以將降低脫靶效應。金斯瑞為您提供Broad研究所驗證的Nickase Cas9助力您在哺乳動物細胞里的基因編輯。

SaCas9 載體
從金黃色葡萄球菌或SaCas9中提取的Cas9同源物與SpCas9具有相似的效率;然而,SaCas9長度比SpCas9大約小于1kb。SaCas9的主要優勢是腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)包裝:AAV的載體大小約為4.5kb,因此將SpCas9與AAV包裝在一起可能具有挑戰性(Ran et al., 2015)。相對較小的SaCas9利用AAV載體進行CRISPR基因編輯成為可能??紤]到這一結構的免疫原性較低,因此SaCas9更適合于體內編輯應用,如用于治療。
Transcription Activation (SAM) 載體
CRISPR/Cas9 Synergistic Activation Mediator (SAM) )是一種蛋白質復合物,可增強內源性基因(一次一個基因,或同一細胞中同時有多達10個基因)的轉錄。SAM利用Cas9核酸酶的特異性和易用性,通過gRNA將Cas9核酸酶定位于內源性基因組的特定位點。Genscript與Broad Institute*簽訂了許可協議,提供經過驗證的SAM gRNA序列,可針對人類基因組中的任何編碼區域,并為任何其他物種提供免費的SAM gRNA設計服務。
SAM復合體由三個組件組成
- 剪切失活的dCas9-VP64融合蛋白:使用dCas9確保內源性基因組中沒有鏈斷裂;VP64是一個轉錄激活域,與p65和HSF1協同作用,增強轉錄。
- 一個包含兩個MS2 RNA適配體的sgRNA:sgRNA的設計目標應該是轉錄起始位點上游的前200個bp,以便針對SAM復合物進行理想的轉錄激活。雖然sgRNA通常與Cas9結合,但需要MS2 RNA適配體才能使SAM復合體的第三個成員與Cas9-sgRNA復合物結合。
- MS2-P65-HSF1激活輔助蛋白:包含兩個轉錄激活域P65和HSF1,與VP64協同作用,強力激活下游編碼區域的轉錄。MS2結構域允許其輔助蛋白與sgRNA-dCas9復合物結合。
CRISPR 載體規格
服務 | 載體 | Cas9/gRNA 表達系統 | 交付類型 | 載體類型 | 篩選標記 |
---|---|---|---|---|---|
eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-2A- GFP (PX458) New! | eSpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-2A- Puro (PX459) V2.0 New! | eSpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-LentiCRISPR v2 New! | eSpCas9 & gRNA | Lentiviral | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 BB-2A-GFP PX458 | SpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 BB-2A-Puro (PX459) v2.0 | SpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCRISPR v2 | SpCas9 & gRNA | Lentiviral | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids SpCas9 Nickase Plasmids |
pLentiGuide-Puro | gRNA Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCas9-Blast | SpCas9 Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR BsdR BleoR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCas9-EGFP | SpCas9 Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pGS-gRNA | gRNA Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Plasmids | pGS-gRNA-Neo | gRNA Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR NeoR |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 PX165 | SpCas9 Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Plasmids | pAAV_SpGuide acceptor (PX552) | gRNA Only | AAV | Dual Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pAAV-SpCas9 PX551 | SpCas9 Only | AAV | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB PX460 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB-2A-GFP PX461 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB-2A-Puro (PX462) V2.0 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pLentiCas9n-Blast | SpCas9 Nickase Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR BsdR BleoR |
SaCas9 Plasmids | pX601_AAV | SaCas9 & gRNA | AAV | All-in-one Vector | AmpR |
Transcription Activation (SAM) | pSgRNA(MS2) | gRNA Only | Plasmid | SAM Multi Vector | AmpR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_sgRNA(MS2)_zeo | gRNA Only | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR ZeoR BeloR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_dCas9-VP64_Blast | Cas9 Activator | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR BlastR BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_dCas9-VP64_GFP | Cas9 Activator | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR EGFP BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_MS2-P65-HSF1_Hygro | Activator Adapter | Lentiviral | Multi Vector | AmpR HygroR BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_MS2-P65-HSF1_GFP | Activator Adapter | Lentiviral | Multi Vector | AmpR EGFP BleoR |
- CRISPR手冊: CRISPR/Cas9 基因編輯的綜合性指南
- CRISPR RNP使用指南:如何在基因編輯中使用CRISPR RNP
- 常見問題
- 案例分享
如果對于CRISPR 質粒有任何問題或建議,請聯系金斯瑞專業技術支持人員。